Saude: Uma nova tecnologia que ajuda a detectar mutações cancerígenas futuras

Uma equipe de pesquisa em genômica da UPF (Universidade Pompeu Fabra), na Espanha, desenvolveu um sistema tecnológico por intermédio de um site, o qual é aberto a toda a comunidade científica, o que é poderá ajudar a detectar e identificar tipos mutações cancerígenas.

Esta nova ferramenta o qual foi nomeada de “OncoPaD” que desenha um tipo de painéis de sequenciamento genético para o câncer.

Segundo os líderes deste estudo, Abel González-Pérez e Núria López-Bigas, o tratamento rápido e correto e o diagnóstico de câncer dependem muito cada vez mais de uma análise genética dos pacientes.

Nessa análise, os médicos buscam algumas alterações no DNA do tumor, chamadas de mutações, que possam ter um valor de diagnóstico, ou de de previsão ou terapêutico para a doença.

Para que possa ser identificada estas “mutações”, é necessario que os biólogos faça a sequencia do DNA do tumor, seja abrangendo todo o seu genoma, o exoma (é a a parte de um genoma que codifica os genes) ou certos genes ou algumas regiões genéticas, que são incluidas nos painéis.

Segundo o time de pesquisadores, este sequenciamento por painéis oferece mais vantagens devido, além de contar com um melhor coeficiente de custo-benefício , os painéis podem detectar menos falsos positivos graças a maior sensibilidade.

Há painéis de sequenciamento atualmente pré-desenhados e comercializados por várias empresas, porem normalmente são painéis não específicos, pois são planejados para sequenciar e identificar qualquer tipo de tumor.

A relação custo e benefício para responder algumas perguntas específicas, por exemplo o diagnóstico precoce de um tipo de tumor concreto, costuma-se ser menor pois a maioria das regiões genômicas incluídas resultam irrelevantes.

Por este motivo , os pesquisadores e clínicos, resolveram, e decidem desenhar painéis específicamente adaptados à pergunta exata que tentam responder.

Para que sejam confeccionados a lista dos genes ou as regiões genéticas adequadas a ser incluídas nos painéis , os pesquisadores tem que realizar uma busca demorada em estudos científicos anteriores e integrar as informação de bases de dados que se encontram na internet.

Apesar disso tudo, é muito difícil estimar por antecipação o coeficiente de custo-benefício do painel projetado no grupo de pacientes com o tipo de câncer de interesse.

Para que sejam resolvidas estes problemas, o grupo de Genômica do Programa de Pesquisa em Informática Biomédica (GRIB), o programa conjunto entre a Universidade Pompeu Fabra (UPF) e também o Instituto Hospital del Mar de Pesquisas Médicas (IMIM), foram que criaram OncoPaD.

Segundo estes pesquisadores, da primeira ferramenta na internet aberta a toda a comunidade científica para que possam desenhar os painéis de sequenciamento por câncer que levam em conta o conhecimento prévio relevante ao tipo de tumor de interesse e o custo-benefício estimado pode ser ajustado pelos pesquisadores.

“Com esta interface simples e intuitiva, a ferramenta OncoPaD identifica que genes ou regiões são os melhores candidatos para o desenho de um painel específico, com base na associação conhecida dos genes com mecanismos de desenvolvimento do câncer ou resposta a fármacos contra este e maximizando seu coeficiente de custo-benefício”, explicou Carlota Rubio-Pérez, autora do estudo, publicado na revista “Genome Medicine”.

fonte: artigo Cience – EFE